细胞壁是位于细菌细胞最外面的一层厚实、坚韧的外被，无色透明，主要成分是肽聚糖，有固定外形并具保护细胞等多种作用。肽聚糖是由N-乙酰葡萄糖胺和N-乙酰胞壁酸两种氨基糖经β-1，4糖苷键连接间隔排列形成的多糖支架。细胞壁厚度因细菌不同而异，一般为15~30nm。N-乙酰胞壁酸分子上有四肽侧链，相邻聚糖纤维之间的短肽通过肽桥（革兰氏阳性菌）或肽键（革兰氏阴性菌）桥接起来，形成了肽聚糖片层，像胶合板一样，粘合成多层。

　　细胞质膜是紧贴在细胞壁内侧并包围细胞质的一层柔软且富有弹性的半透性薄膜，是重要的代谢活动中心，对于细菌的呼吸、能量的产生、运动、生物合成、内外物质的交换运送等均有重要的作用。

　　细胞质是由细胞质膜包围着的除拟核以外一切透明、胶状和颗粒状物质的总称。细胞质具有维持细胞内环境平衡等多种功能。分散于细胞质中的核糖体颗粒是蛋白质合成的场所。

　　拟核位于细胞质内，是一种没有核膜、没有核仁、没有固定形态、结构也较简单的原始形态的核，其实质是一个大型环状的双链 DNA分子，是负载细菌遗传信息的物质基础。鞭毛是某些细菌表面着生的一至数根由细胞内伸出的细长、波曲的丝状体,具有运动的功能。鞭毛在菌体上的着生位置和数目因种而异。觉

　　菌毛（又名纤毛）是在细菌体表的比鞭毛更细、更短、直硬日数量较多（250~300根)的丝状体，与细菌吸附或性结合有关。

　　荚膜是某些细菌向细胞壁表面分泌的一层厚度不定的胶状物质。用显微镜观察可发现，英膜中心部位是细菌菌体。在暗色背景下荚膜呈透明状环绕菌体，具有抗干燥、抗吞噬和附着作用。

　　芽孢是某些细菌于生长后期在细胞内形成的一个圆形、椭圆形或圆柱形的休眠体。能产生芽孢的多为杆菌。芽孢直径大于或小于等于菌体宽度。芽孢具有极强的抗热、抗辐射、抗化学药物和抗静水压等特性，堪称生命世界之最。所以有些细菌在环境条件不利于生长繁殖时便会形成芽孢。